Начало музейной коллекции было положено в 1768 году, когда при Королевской академии изящных искусств по указу Карла III были собраны картины преподавателей и учеников академии, а также ряд работ, полученных в дар от частных владельцев.Помимо обширной пинакотеки, музей располагает большой коллекцией эскизов и гравюр, а также скульптур, археологических находок, фотографий и декоративного искусства.Музей специализируется на готической живописи и насчитывает в своей коллекции около 2000 картин, среди которых большое число картин валенсийских художников 14 и 15 веков.