Ныне коллекции музея насчитывают около 25 тысяч произведений живописи, графики, скульптуры, декоративно-прикладного искусства. Особую ценность представляют памятники древнерусской иконописи второй половины XVI века из Успенского собора г. Свияжска, произведения ранней европейской гравюры XV—XVI веков М.Шонгауэра, А.Дюрера, Л.Лейденского, М.Раймонди и др., крупнейшее в нашей стране собрание произведений Николая Ивановича Фешина, коллекция живописи и графики И. И. Шишкина, собрание произведений русского авангарда начала XX века,